男主原是現(xiàn)代世界普通大學生，某天偶遇算命人并被告知災禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過山海玄中錄且答應完成書中各妖娘所在世界對應的任務......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁出現(xiàn)攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個攻略任務。

葉凡作為“星殺術”的傳人，身負異能進入大學校園。然而他發(fā)現(xiàn)，周圍有自己這種“異能”的人不止自己一個。同寢室的室友嚴冰、學生會會長、同級的女神葉蘋，都身懷絕技。身邊時常能感受到奇怪的目光，好像四周有人總在黑暗中隱隱的窺探。似乎父親傳授給自己的“星殺術”，將自己帶入了一個危險的境地？“血色黃昏”又是什么組織？他的大學生涯，看來注定無法平靜。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫(yī)發(fā)揚光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機，因為中醫(yī)不容樂觀的就業(yè)情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監(jiān)督者。